Modèles animaux : génétique de la souris

159 Pages·2013·3.62 MB·French

Modèles animaux :
génétique de la souris
Jean Jaubert
1
Plan général
Eléments de nomenclature
- Origine des souris de laboratoire
- Données Génétiques de base pour la souris
- Les types de lignées : consanguines, congéniques, consomiques,
recombinantes consanguines, recombinantes congéniques;
les colonies non consanguines
- Effet du fonds génétique
- Contrôle de qualité génétique
- La séquence et après…
2
Origine des souris
3
Origine des souris de laboratoire
Ancestral
Mus musculus
species
1 M
domesticus castaneus musculus
années
molossinus
2000
ans
European East asian
fancy mouse fancy mouse
100
ans
Laboratory
strains
Wade et al. (2002), Nature, 420, 574-578 4
Phylogénie des souris
domesticus
M
musculus .

m
u
molossinus s
c
u
l
u
castaneus s
bactrianus
M. spicilegus
M. macedonicus
M. spretus
M. caroli
M. cooki
M. cervicolor
M
2 1 1 0 0 0 .A
,4 ,7 ,1 ,3 ,2 .
0 5 0 5 3
5
Miss Abbie C. Lathrop
Origine des principales lignées consanguines
d'après Mouse in BiomedicalResearch
Ed. by Henry L. Foster, J. David Small and James G. Fox
6
Academic Press, 1981
William E.
Castle
(1867-1962)
Clarence C.
Little
(1888-1971)
LeonellC.
Strong
7
C3H
DBA/2
SJL/J BALB/c
129
FVB/N
ICR
C57BL/6
CAST
ftp://ftp.informatics.jax.org/pub/datasets/misc/genealogy/genealogy.pdf
8
Eléments de nomenclature
9
La nomenclature
- Elle est indispensable
- Elle doit être rigoureuse
- Elle apporte des informations
… malheureusement, les règles dépendent des espèces !
Référence (Mouse Genome Informatics ou MGI)
- http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen
10