ISOLASI, SELEKSI DAN UJI AKTIVITAS ANTIBAKTERI MIKROBA ENDOFIT DARI DAUN ...

116 Pages·2008·5.5 MB·English

UIN SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA

ISOLASI, SELEKSI DAN UJI AKTIVITAS
ANTIBAKTERI MIKROBA ENDOFIT DARI DAUN
TANAMAN Garcinia benthami Pierre TERHADAP
Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli,
Shigella dysenteriae, dan Salmonella typhimurium

SKRIPSI

ARINI EKA PRATIWI
NIM. 1111102000051

PROGRAM STUDI FARMASI
FAKULTAS KEDOKTERAN DAN ILMU KESEHATAN
JAKARTA
JUNI 2015
UIN SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA

ISOLASI, SELEKSI DAN UJI AKTIVITAS
ANTIBAKTERI MIKROBA ENDOFIT DARI DAUN
TANAMAN Garcinia benthami Pierre TERHADAP
Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli,
Shigella dysenteriae, dan Salmonella typhimurium

SKRIPSI
Diajukan sebagai salah satu syarat memperoleh gelar Sarjana Farmasi

ARINI EKA PRATIWI
NIM. 1111102000051

PROGRAM STUDI FARMASI
FAKULTAS KEDOKTERAN DAN ILMU KESEHATAN
JAKARTA
JUNI 2015
ii
iii
iv
v
ABSTRAK

Nama : Arini Eka Pratiwi
Program Studi : Farmasi
Judul Skripsi : Isolasi, Seleksi dan Uji Aktivitas Antibakteri Mikroba
Endofit dari Daun Tanaman Garcinia benthami Pierre
terhadap Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis,
Escherichia coli, Shigella dysenteriae, dan Salmonella
typhimurium

Mikroba endofit dapat ditemukan di hampir setiap tanaman di bumi. Mikroba
endofit adalah mikroba yang hidup di dalam jaringan tumbuhan pada periode
tertentu dan mampu membentuk koloni dalam jaringan tumbuhan tanpa
membahayakan inangnya, bahkan seringkali bersimbiosis secara mutualisme.
Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan menyeleksi isolat mikroba endofit
dari daun Garcinia benthami Pierre yang berpotensial dalam menghasilkan
senyawa antibakteri. Aktivitas antibakteri isolat mikroba endofit dapat dilihat dari
pembentukan zona hambat di sekitar koloni menggunakan metode difusi agar
padat dan difusi cakram dengan bakteri patogen yaitu Staphylococcus aureus
ATCC 6538, Bacillus subtilis ATCC 6633, Escherichia coli ATCC 35218,
Shigella dysenteriae ATCC 13313 dan Salmonella typhimurium ATCC 14028.
Hasil isolasi mikroba endofit dari daun Garcinia benthami Pierre memberikan 18
isolat kapang endofit dan 7 isolat bakteri endofit. Fermentasi dilakukan terhadap 6
isolat kapang endofit pada media Potato Dextrose Yeast (PDY) selama tiga
minggu dengan kondisi stasioner dan 7 isolat bakteri endofit pada media Nutrient
Broth (NB) selama dua hari dengan kultur kocok. Hasil fermentasi kapang endofit
menunjukkan bahwa isolat kapang GB2, GB8, GB14, GB16, GB17, dan GB18
aktif terhadap Bacillus subtilis ATCC 6633; isolat kapang GB18 aktif terhadap
Escherichia coli ATCC 35218; isolat kapang GB2, GB16, dan GB17 aktif
terhadap Shigella dysenteriae ATCC 13313; isolat kapang GB2 dan GB8 aktif
terhadap Salmonella typhimurium ATCC 14028. Hasil fermentasi bakteri endofit
menunjukkan bahwa isolat bakteri IGB1, IGB2, IGB3, IGB4, IGB5, IGB6, dan
IGB7 aktif terhadap Escherichia coli ATCC 35218; isolat bakteri IGB3, IGB5,
dan IGB6 aktif terhadap Staphylococcus aureus ATCC 6538; isolat bakteri IGB1
dan IGB3 aktif terhadap Bacillus subtilis ATCC 6633; isolat bakteri IGB3 dan
IGB6 aktif terhadap Shigella dysenteriae ATCC 13313; isolat bakteri IGB3 aktif
terhadap Salmonella typhimurium ATCC 14028.

Kata Kunci: Garcinia benthami Pierre, mikroba endofit, antibakteri, metode difusi
agar padat, metode difusi cakram.
vi
ABSTRACT

Nama : Arini Eka Pratiwi
Program Studi : Farmasi
Judul Skripsi : Isolation, Selection and Antibacterial Assay of Endophytic
Microbes from the Leaves of the Plant Garcinia benthami
Pierre against Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis,
Escherichia coli, Shigella dysenteriae, and Salmonella

typhimurium

Endophytic microbes can be found in almost every plant on earth. Endophytic
microbes are microbes that live inside plant tissues on certain periodes and is able
to form a colony inside plant tissues without indangering the host of the plant,
moreover it undergoes symbyosis mutualistically. The purpose of this research
was to isolate and select endophytic microbes from Garcinia benthami Pierre
leaves that have potential to produce antibacterial compounds. Antibacterial
activity was determined by measuring the inhibition zone with Diffusion Agar
Plate and Disc Diffusion methods using pathogenic bacteria i.e. Escherichia coli
ATCC 35218, Staphylococcus aureus ATCC 6538, Bacillus subtilis ATCC 6633,
Shigella dysenteriae ATCC 13313 and Salmonella typhimurium ATCC 14028.
The results of the endophytic microbes isolation in these experiments showed that
there were 18 isolates of endophytic fungi and 7 isolates of endophytic bacteria.
Fermentation carried out against 6 isolates of endophytic fungi in medium Potato
Dextrose Yeast (PDY) for three weeks with stationary conditions and 7 isolates of
endophytic bacteria in medium Nutrient Broth (NB) for two days with shaker
culture. The result of the endophytic fungi fermentation showed that GB2, GB8,
GB14, GB16, GB17, and GB18 isolates of fungi were active against Bacillus
subtilis ATCC 6633; GB18 isolates of fungi were active against Escherichia coli
ATCC 35218; GB2, GB16, and GB17 isolates of fungi were active against
Shigella dysenteriae ATCC 13313; GB2 and GB8 isolates of fungi were active
against Salmonella typhimurium ATCC 14028. The result of the endophytic
bacteria fermentation showed that IGB1, IGB2, IGB3, IGB4, IGB5, IGB6, and
IGB7 isolates of bacteria were active against Escherichia coli ATCC 35218;
IGB3, IGB5, and IGB6 isolates of bacteria were active against Staphylococcus
aureus ATCC 6538; IGB1 and IGB3 isolates of bacteria were active against
Bacillus subtilis ATCC 6633, IGB3 and IGB6 isolates of bacteria were active
against Shigella dysenteriae ATCC 13313, IGB3 isolates of bacteria were active
against Salmonella typhimurium ATCC 14028.

Keyword: Garcinia benthami Pierre, endophytic microbes, antibacterial, diffusion
agar plate methods, disc diffusion methods.

vii
KATA PENGANTAR

Bismillahirrahmannirrahim
Alhamdulillahirabbil’alamin, puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah
melimpahkan segala rahmat dan karunia-Nya, sehingga penulis dapat
menyelesaikan penulisan skripsi dengan judul “Isolasi, Seleksi dan Uji Aktivitas
Antibakteri Mikroba Endofit dari Daun Tanaman Garcinia benthami Pierre
terhadap Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli, Shigella
dysenteriae, dan Salmonella typhimurium”. Shalawat serta salam semoga
senantiasa tercurah limpahkan pada Nabi Muhammad SAW beserta para keluarga
dan sahabatnya.
Skripsi ini disusun sebagai salah satu syarat kelulusan tingkat sarjana di
Program Studi Farmasi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas
Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta. Penelitian ini tidaklah dapat
terselesaikan tanpa dukungan dan bantuan dari berbagai pihak. Dalam kesempatan
ini, penulis ingin mengucapkan terima kasih terkhususkan kepada:
1. Ibu Puteri Amelia, M.Farm., Apt. selaku pembimbing I dan Bapak Saiful
Bahri, M.Si selaku pembimbing II, yang telah meluangkan waktu, tenaga, dan
pikiran serta dengan sabar membimbing dan mengajari penulis sehingga
penulis dapat menyelesaikan skripsi ini.
2. Bapak Dr. H. Arif Sumantri, S.KM., M. Kes, selaku Dekan Fakultas
Kedokteran dan Ilmu Kesehatan UIN Syarif Hidayatullah Jakarta.
3. Bapak Yardi, Ph.D., Apt., selaku Ketua Program Studi Farmasi UIN Syarif
Hidayatullah Jakarta.
4. Ibu/Bapak Dosen dan Staf Akademika Program Studi Farmasi UIN Syarif
Hidayatullah Jakarta yang telah memberikan ilmunya kepada penulis.
5. Ayahanda tercinta, Bapak Nurtejo dan Ibunda tercinta, Ibu Rosadah terima
kasih atas doa yang selalu tercurah untukku, kasih sayang, dan dukungannya
yang menguatkan penulis dalam menyelesaikan skripsi ini.
viii
6. Adikku tersayang Rashanda dan Quesy Al Farroby yang selalu mendoakan
dan menghibur disaat penulis kesulitan.
7. Seluruh laboran di PLT dan FKIK, Mba Puji, Mba Festy, Kak Amal, dan Mba
Rani yang telah banyak membantu selama proses penelitian.
8. Teman-teman seperjuangan mikrobiologi yakni Brasti, Ati, Rahma, Puput,
Ambar, Meri, Imeh, Fitri, Cumi, Dila, Syaima, Adit, BTR, dan Mozer.
9. Sahabat-sahabatku yaitu Sheila, Meryza, Puput, dan Athiyah.
10. Seluruh teman-teman Farmasi Angkatan 2011 BD. Kebersamaan kita di dalam
suka dan duka akan selalu terkenang di dalam hati.
11. Serta semua pihak yang tidak dapat disebutkan satu persatu yang turut
membantu menyelesaikan skripsi ini.
Dengan keterbatasan pengalaman, pengetahuan, maupun pustaka yang
ditinjau, penulis menyadari bahwa dalam skripsi ini terdapat banyak kekurangan.
Untuk itu penulis sangat mengharapkan kritik dan saran. Semoga skripsi ini dapat
memberikan manfaat bagi kepentingan keilmuan maupun aplikasi di bidang
kesehatan.

Jakarta, 19 Juni 2015

Penulis

ix
x