Génomique comparative et alignement de séquences

115 Pages·2009·2.13 MB·French

by  Catherine Matias

G´enomique comparative et Alignement de
s´equences biologiques
Catherine Matias
CNRS-LaboratoireStatistique&G´enome,E´vry
E´tats de la Recherche de la SMF-oct 2009
Sommaire :
Introduction `a la biologie mol´eculaire
Partie II : Alignement par fonction de score
Partie III : Alignement statistique
Partie IV : Alignement multiple
Premi`ere partie I
Introduction `a la biologie mol´eculaire
Sommaire : Introduction `a la biologie mol´eculaire
Biologie mol´eculaire
G´enomique comparative
Alignement
Repr´esentation graphique de l’alignement de deux s´equences
Sommaire
Biologie mol´eculaire
G´enomique comparative
Alignement
Repr´esentation graphique de l’alignement de deux s´equences
La cellule (avec ou sans noyau)
L’information g´en´etique : les chromosomes
Chez l’Homme, 22 paires de chromosomes plus une paire de
chromosomes sexuels
L’information g´en´etique : l’ADN
Chez l’Homme, 3,4 milliards de paires de bases
4 bases diff´erentes : A,C, G et
T
Appariement C/G et A/T
L’expression des g`enes
Un g`ene = une petite unit´e d’ADN, qui code une prot´eine
Au final
I De nos jours, on est capables
I de «s´equencer les g´enomes des organismes»
I de connaˆıtre la s´equence d’une prot´eine
I Les s´equences biologiques = soit des s´equences d’ADN, soit
des s´equences d’acides amin´es
I On ne sait rien sur la plupart des s´equences (fonction,
structure...)
I La g´enomique comparative consiste `a comparer une
s´equence inconnue avec une base de donn´ees de s´equences
connues pour tenter d’en tirer de l’information