Epidémiologie de la brucellose et de la tuberculose animales dans les milieux urbain, périurbain et

212 Pages·2013·7.13 MB·French

Académie Universitaire Wallonie-Europe
UNIVERSITE DE LIEGE - FACULTE DE MEDECINE VETERINAIRE
DEPARTEMENT DES MALADIES INFECTIEUSES ET PARASITAIRES
Service d’Epidémiologie et Analyse de Risques appliquées aux sciences
vétérinaires

INSTITUT DE MEDECINE TROPICALE D’ANVERS
DEPARTEMENT DES SCIENCES BIOMEDICALES

Epidémiologie de la brucellose et de la tuberculose
animales dans les milieux urbain, périurbain et rural au
Niger

Epidemiology of animal brucellosis and tuberculosis in the
urban, suburban and rural areas in Niger

Abdou Razac BOUKARY

THESE PRESENTEE EN VUE DE L’OBTENTION DU GRADE DE
DOCTEUR EN SCIENCES VETERINAIRES
ORIENTATION MEDECINE VETERINAIRE

ANNEE ACADEMIQUE 2012-2013

ACADEMIE UNIVERSITAIRE WALLONIE-EUROPE
UNIVERSITE DE LIEGE - FACULTE DE MEDECINE VETERINAIRE
DEPARTEMENT DES MALADIES INFECTIEUSES ET PARASITAIRES
Service d’Epidémiologie et Analyse de Risques appliquées aux sciences
vétérinaires

INSTITUT DE MEDECINE TROPICALE D’ANVERS
DEPARTEMENT DES SCIENCES BIOMEDICALES

Epidémiologie de la brucellose et de la tuberculose animales
dans les milieux urbain, périurbain et rural au Niger

Epidemiology of animal brucellosis and tuberculosis
in the urban, suburban and rural areas in Niger

ABDOU RAZAC BOUKARY

Promoteurs :
- Prof. Claude SAEGERMAN, Service d’Epidémiologie et Analyse de Risques
appliquées aux sciences vétérinaires, Département des Maladies Infectieuses et
Parasitaires, Faculté de Médecine Vétérinaire, Université de Liège
- Dr Eric THYS, Département des Sciences Biomédicales, Institut de Médecine
Tropicale d’Anvers

« Les scientifiques, dans une démocratie, doivent influencer les décideurs
en mettant l'accent sur la gravité de certains problèmes. »

Trinh Xuan Th

Remerciements

Remerciements
Au terme de la présente thèse, je tiens tout d’abord à rendre un vibrant hommage à mes Promoteurs
ainsi qu’à tous les membres de mon Comité de thèse pour avoir accepté de superviser ce travail dans
un cadre interactif et multidisciplinaire.

Au Professeur Claude SAEGERMAN pour avoir accepté le pari inédit d’encadrer ce travail dans un
contexte particulièrement atypique alliant plusieurs secteurs d’activités aux sensibilités et intérêts
souvent divergents. Professeur, par votre clairvoyance et votre rigueur scientifique, vous avez su à
temps donner les orientations scientifiques pertinentes qui ont permis l’atteinte des résultats présentés
dans cette thèse. Tout au long de ma formation doctorale, vous avez répondu promptement à toutes
mes sollicitations et j’ai pu bénéficier de votre expérience scientifique et de vos encouragements. Je
vous prie d’accepter l’expression de mes sincères remerciements.

Au Docteur Eric THYS, je ne sais comment vous remercier pour l’énorme soutien que vous m’avez
apporté tout au long de cette thèse. Grand merci à vous pour m’avoir fait confiance en acceptant de
défendre ma candidature de thèse et de parrainer ce travail dont vous avez été le garant de la réussite.
En effet, vous avez su coordonner avec une méthodologie efficace et rigoureuse l’ensemble des
travaux relatifs à la présente thèse. Votre appui scientifique ainsi que votre soutien moral et financier
ont été déterminants dans la réussite de ce travail. Veuillez trouver l’expression de ma profonde
reconnaissance.

J’exprime ma profonde gratitude au Professeur Alhassane YENIKOYE, pour l’appui constant à la
réalisation de cette thèse. Professeur, vous m’avez adopté et prodigué des sages conseils dans des
périodes souvent difficiles. Malgré vos multiples charges rectorales, votre porte m’a été toujours
ouverte et vous m’avez fait bénéficier de votre grande expérience scientifique et de nombreuses
facilitations à la réalisation de mes travaux sur le terrain. Cher Papa, merci du fond du cœur pour votre
inestimable soutien.

Mes sincères remerciements au Prof. Dr Patrick VAN DER STUYFT et au Dr Annick LINDEN
membres de mon comité de thèse pour le suivi constant et leurs contributions scientifiques de haut
niveau à l’évaluation de mes travaux. J’exprime également mes sincères remerciements au Professeur
Françoise PORTAELS, au Dr Maryse FAUVILLE-DUFAUX, au Prof. Jean-Luc HORNICK, au Prof.
Frédéric FARNIR, au Prof. Hugues GUYOT et au Dr Bernard TAMINIAU pour leurs contributions
scientifiques respectives et pour avoir accepté d’évaluer cette thèse malgré leurs multiples
occupations.
Remerciements

Un tout grand merci au Dr Leen RIGOUTS pour sa contribution inconditionnelle à la réalisation des
travaux de laboratoire concernant l’analyse des échantillons de biopsie et le typage moléculaire de
Mycobacterium bovis. Chère Leen, merci pour votre amitié, vos précieux conseils et la sympathie avec
laquelle vous m’avez toujours accueilli au sein de votre laboratoire. J’adresse aussi mes sincères
remerciements à Monsieur David FRETIN, à Monsieur Karl WALRAVENS et l’ensemble des
techniciens du CERVA pour l’aide combien inestimable qu’ils m’ont apportée pour la formation en
techniques de laboratoire, la réalisation des analyses sérologiques ainsi que le typage des souches de
Brucella spp.

Mes sincères remerciements à l’ensemble de mes collègues de l’ONG Karkara pour le soutien sans
faille qu’ils m’ont accordé tout au long du travail. En particulier, j’exprime toute ma gratitude à mon
grand frère et ami, Monsieur Amadou Cheiffou BARRE pour son encouragement, sa constante
disponibilité et ses sages conseils dans des moments délicats. Je dis merci à tout le personnel
administratif, au personnel de soutien et aux stagiaires de Karkara qui ont été une famille pour moi
durant tout ce processus. Un grand merci à Monsieur Salissou YAHOUZA pour m’avoir autorisé et
encouragé à entreprendre cette thèse.

J’adresse mes vifs remerciements au Prof. Dirk BERKVENS que j’appelle affectueusement mon père
spirituel. Malgré vos multiples occupations, vous avez toujours été à l’écoute de mes questions et les
orientations que vous m’avez données ont été utiles pour moi au-delà de cette thèse car grâce à vos
enseignements, j’ai pu disposer d’un fondement statistique solide et d’un esprit critique somme toute
indispensable à la démarche scientifique. Grand merci au Dr Emmanuel ABATIH pour son appui
décisif dans les traitements statistiques et la modélisation des données. Emmanuel, merci encore pour
ta disponibilité et pour l’affection que tu m’as toujours témoignée.

J’exprime toute ma gratitude à mes amis de toujours, Dr Malick HAIDO JACKOU et Dr Gilles Vias
FRANK pour leurs encouragements et leur soutien inconditionnel à la réalisation de cette thèse. Chers
amis, vous avez toujours été là quand ça va, mais aussi et surtout quand ça ne va pas. Trouvez là
l’expression de ma profonde reconnaissance à votre égard pour le soutien que vous avez toujours
apporté à ma famille pendant les longues absences occasionnées par mes travaux.

Qu’il me soit permis d’exprimer toute ma gratitude à l’ensemble du personnel de l’IMT qui s’est
occupé de moi aussi bien sur le plan académique que social. Je commencerais par dire un grand merci
à mon amie personnelle, Danielle DEBOIS, pour sa gentillesse, l’accueil chaleureux qu’elle m’a
toujours réservé et sa constante disponibilité. Un tout grand merci à tous mes enseignants en
particulier au Prof. Stanny GEERTS, au Prof. Pierre DORNY et au Dr Redgi DE DEKEN pour
l’accueil cordial qu’ils m’ont réservé. Leur appui scientifique a été déterminant tout au long de ma
Remerciements

formation à l’IMT. Je rends un vibrant hommage à la mémoire du Dr Francine MATTHYS pour son
apport inestimable à la réalisation de cette thèse. Un grand merci également à Anke VAN HUL, à
Cecile UWIZEYE et tout le personnel de laboratoire pour leur appui, sans oublier l’ensemble du
personnel du service étudiant pour les nombreuses facilitations.

Mes sincères remerciements vont aussi aux membres de l’Unité d’Epidémiologie et d’Analyse de
Risques appliquées aux sciences vétérinaires (UREAR-ULg), à l’ensemble du personnel administratif
de la Faculté Médecine Vétérinaire de l’ULg pour les nombreuses facilitations. En particulier,
j’adresse un grand merci à Marie-France HUMBLET pour sa gentillesse et son appui scientifique. Un
tout grand merci également à Christina ESPERT et Jessica COLLARD, secrétaires du Département
des Maladies Infectieuses et Parasitaires pour l’appui à la mise en forme de mon document de thèse.

L’une des particularités de ce travail est son caractère multidisciplinaire. Il allie pour une des
premières fois au Niger des Médecins et Vétérinaires sur une même thématique. Je voudrais à cet
égard souligner et féliciter mes amis de la Médecine humaine. L’intérêt et le grand enthousiasme
qu’ils ont manifestés dès le début de ce travail ont permis de relever un grand défi, celui de la mise en
place d’un cadre conjoint de réflexion et d’action dans la lutte contre les maladies zoonotiques au
Niger. Mes sincères remerciements vont particulièrement au Prof. Eric ADEHOSSI, au Prof. Saidou
MAHAMADOU et au Dr Abdou Malam BADE pour leur contribution inconditionnelle.

J’adresse aussi mes sincères remerciements à tout le personnel de l’abattoir de Niamey, en particulier à
Monsieur Aboubacar AMANKAY, au Dr Ibrahima MAHAMADOU, au Dr Sido SOULEY pour
m’avoir permis un accès permanent à l’abattoir et pour leur disponibilité et leur contribution dans la
collecte des données et des échantillons d’organes.
Je remercie très sincèrement l’ensemble de mes collègues du Haut Commissariat à l’initiative 3N et de
la Présidence de la République du Niger, et au premier rang desquels Monsieur Amadou Diallo
ALLAHOURI pour leur soutien et leurs encouragements dans l’achèvement de ce travail.

Un grand merci à tous ceux qui ont contribué à la réussite de ce travail au niveau du terrain,
particulièrement mes amis Amadou TOUJANI et Boubacar ALZOUMA de l’association Gajel Sudu-
Baba, les agents des services d’élevage de Niamey, de Torodi, de Balleyara ainsi que les honorables
chefs coutumiers de ces zones pour leur implication sans réserve et leur contribution à ce travail.

Cette thèse n’aurait pas été possible sans le soutien affectif et la compréhension de ma famille. Je
dédie ce travail à la mémoire de mon père qui nous a quittés si tôt mais qui a su me guider dans le
droit chemin, à ma mère qui a tout fait et qui représente tout pour moi, à ma femme Ami, à mes
Remerciements

enfants Omar, Fatouma-Zara et Ismael et à mes frères et sœurs. Merci à tous de votre patience et de
votre inestimable soutien.

J’exprime ma profonde gratitude à la mémoire du Prof. André BULDGEN à qui je suis profondément
attaché pour sa gentillesse et sa constante disponibilité et aussi pour toute l’aide qu’il m’a apportée
dans les moments difficiles. J’exprime aussi toute ma reconnaissance à sa veuve Marielle et ses
enfants Clara et Céline pour leur affection à mon égard, qu’elles trouvent là, l’expression de ma
sincère amitié. Mes sincères remerciements au Prof. Chedly KAYOULI et toute sa famille. Je remercie
aussi vivement Géneviève, Jean, Bernadette SMETS, Prof André THEWIS et tout le personnel de
l’unité de Zootechnie de Gembloux Agro-Bio Tech (ULg) pour l’accueil chaleureux qu’ils m’ont
toujours réservé.

Ce travail a été rendu possible grâce au financement de la Direction Générale du Développement
(DGD) à qui j’exprime ma profonde gratitude. Je remercie également VSF-Belgium pour l’appui
apporté au déroulement des travaux sur le terrain. Mes remerciements vont également à Merial pour le
sponsoring ayant permis l'impression de cette thèse.

Je ne saurais terminer mes propos sans adresser un grand merci à mes amis, Sébastien GROLET,
Steven De CLERK, Remi SCHIFFELEERS et à toute la communauté nigérienne en Belgique pour le
soutien moral et matériel inconditionnel.