ARCAD plateaux technologiques Laboratoire ADN

20 Pages·2014·0.83 MB·French

by  Olivia Guezello

ARCAD plateaux technologiques
Laboratoire ADN
-Laboratoire de purification de l’ADN à
haut débit – Banque d’ADN
-Laboratoire de séquençage et génotypage
Responsables
Sylvain SANTONI, UMR AGAP INRA Montpellier
Pierre MOURNET, UMR AGAP CIRAD Montpellier
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ARCAD plateaux
technologiques
Molécule d’ADN, support de l’information
génétique, rendue accessible pour des
Purification de l’ADN
analyses de génotypage et séquençage
Purification de l’ADN de
plante « à l’ancienne »
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ARCAD plateaux
technologiques
Molécule d’ADN, support de l’information
génétique, rendue accessible pour des
Purification de l’ADN
analyses de génotypage et séquençage
Analyses génétiques réalisées sur de grandes
populations de plantes
- Etudes de la diversité génétique d’une espèce
- Programme d’amélioration des plantes
Besoin de procédures et de protocoles compatibles
avec l’analyse de plusieurs milliers de plantes
Organisation d’un laboratoire pour des analyses à
haut débit. Unité de base : 96 échantillons
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ARCAD plateaux
technologiques
Purification de l’ADN
Poste d’ingénieur, CDD de 20 mois
Michael Bourgeois
Organisation d’un laboratoire spécialisé dans la purification des ADN de plantes
Capable de traiter des milliers d’échantillons
- Extraction/purification
- Contrôles, qualité et quantité
- Gestion des échantillons et traçabilité des opérations
-Pour un usage immédiat en génotypage
-Stockage sécurisé, DNA bank : ressources d’échanges de matériels génétique
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ARCAD plateaux
technologiques
Purification de l’ADN
Maîtrise des
protocoles
biochimiques de
purification des
ADN de plante
Capture de l’ADN sur de la silice
Utilisation de billes métalliques magnétiques
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ARCAD plateaux
technologiques
Purification de l’ADN
Robotique dédiée à la purification
des ADN sur silice/bille magnétique
Format 96 échantillons
2 heures de traitement
Tète 96 ou 24 aimants
Déplacement de billes magnétique
2 KingFisher installés
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ARCAD plateaux Robotique dédiée à la purification de l’ADN pour
des séries importantes d’échantillons
technologiques
Purification de l’ADN
Type LGC Oktopure
Tète 96 pipettes
8 positions magnétiques
8 plaques 96 simultanément
Appel d’offre en cours
Installation prévue début 2015
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ARCAD plateaux Robotique de pipetage à usage universelle, haut
débit, haute performance
technologiques
Purification de l’ADN
Type Beckman FX
Tête 96 pipettes + 8 canaux
indépendants
Soutien / manipulation des ADN
- Dosage
- Ajustement de concentrations
- Etc
Appel d’offre en cours
Installation prévue début 2015
ARCAD plateaux
technologiques
Purification de l’ADN
Qualification/quantification des ADN purifiés
Bioanalyser 96 échantillons
Type Caliper GX
Appel d’offre en cours
Installation prévue fin 2014
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ARCAD plateaux
technologiques
Purification de l’ADN
Qualification/quantification des ADN purifiés
P01
4
P02
P03
3.5
P04
P05
3 P06
P07
2.5 P08
P09
2 P10
P11
1.5 P12
P13
1 P14
P16
P18
0.5
P20
0
220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350
-0.5
Spectrophotomètre/fluorimètre
Type Infinite 200 Tecan
Achat prévu en 2015
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