ANDERSON GARCIA ESTRUTURA E FUNÇÃO DA PROTEÍNA YacG de Klebsiella pneumoniae e

143 Pages·2015·3.2 MB·Portuguese

ANDERSON GARCIA

ESTRUTURA E FUNÇÃO DA PROTEÍNA YacG de Klebsiella pneumoniae e
SEUS DERIVADOS PEPTÍDICOS.

Tese apresentada ao Instituto de Química,
Universidade Estadual Paulista, como
parte dos requisitos para obtenção do
título de Doutor em Biotecnologia.

Orientador: Prof. Dr. Reinaldo Marchetto

Araraquara- SP
2015
FICHA CATALOGRÁFICA

Garcia, Anderson
G216e Estrutura e função da proteína YacG de Klebsiella
pneumoniae e seus derivados peptídicos / Anderson Garcia. –
Araraquara : [s.n], 2015
141 f. : il.

Tese (doutorado) – Universidade Estadual Paulista,
Instituto de Química
Orientador: Reinaldo Marchetto

1. Inibidores enzimáticos. 2. Metaloproteínas.
3. Peptídeos - síntese. 4. Proteínas recombinantes.
5. Agentes antibacterianos. I. Título.

Elaboração: Diretoria Técnica de Biblioteca e Documentação do Instituto de Química de Araraquara
Seção Técnica de Aquisição e Tratamento da Informação

DADOS CURRICULARES

Nome: Anderson Garcia
Nome em citações bibliográficas: GARCIA, A.
Filiação: Maria Rosely Garcia Quintino
Local e Data de nascimento: 22/10/1983, Ourinhos-SP
Estado civil: solteiro
Endereço: Rua Francisco Pires 151, Vila Margarida, Ourinhos -SP
CEP: 19907-400
Telefone: (14) 3302-6400 ramal 6475 / (16)98109-1078
E-mail: [email protected]

Resumo das qualificações: Mestre em Biotecnologia pela Universidade
Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - Unesp, na área de síntese de peptídeos
com ênfase em peptídeos antimicrobianos , Especialista em Bioquímica Aplicada
pela Universidade Estadual De Londrina UEL (2007), Licenciado em Ciências
Biológicas pelas Faculdades Integradas de Ourinhos FIO.

FORMAÇÃO ACADÊMICA

2008 - 2010 Mestrado em Biotecnologia
Universidade Estadual Paulista - Júlio de Mesquita
Filho, Unesp, Instituto de Química de Araraquara.
Título: Peptídeos derivados da proteína bacteriana
YacG: Síntese e estudos de estrutura-função.
Orientador: Prof. Dr. Reinaldo Marchetto.
Bolsista Capes - Coordenação de Aperfeiçoamento
de Pessoal de Nível Superior

2007 - 2007 Especialista em Bioquímica Aplicada
Universidade Estadual de Londrina – UEL
Título: Produção de L-asparaginase por Zymomonas
mobilis CP4, na fermentação de garapa.
Orientador: João Batista Buzato

2003 - 2005 Licenciatura em Ciências Biológicas
Faculdades Integradas de Ourinhos
Título: Generalidades sobre o câncer e sua incidência
na população de Ipaussu.
Orientador: Dalva Regina do Amaral Teixeira

ATUAÇÃO PROFISSIONAL
Professor Universitário
Faculdades Integradas de Ourinhos FIO
De 02/02/2015 até o momento.
TRABALHOS APRESENTADOS EM EVENTOS
GARCIA, A., ZOTTIS, A., ABREU, E. M., MARCHETTO, R. New DNA gyrase
Inhibitor based on YacG protein Structure. In: 5th European Conference on
Chemistry for Life Sciences, 2013, Barcelona. ECCLS 2013 Abstracts Book.
Barcelona: Barceló Events, 2013. v.1. p.171-171;

ROCHA, C. A., GARCIA, A., SANCHEZ, P. R. S., ABREU, E. M., MARCHETTO, R.
New Peptide Inhibitors of Bacterial Topoisomerases In: XLII Annual Meeting of the
Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2013, Foz do iguaçu. XLII
SBBq Abstracts. 2013.

GARCIA, A., ROSSI, D., BARBOSA, L. C. B., DELFINO, D. B., GARRIDO, S. S.,
MARCHETTO, R., VALENTINI, S. R. Klebsiella pneumoniae YacG is a specific
inhibitor of DNA gyrase In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica
e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade
Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular – SBBq, 2012.

BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., DELFINO, D. B., MARCHETTO, R. Peptides from
E. coli ParE as Inhibitors of Topoisomerases: Screening and Characterization of
Protein-protein Interactions In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de
Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual
da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. 2012.

DELFINO, D. B., BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., GARRIDO, S. S., MARCHETTO,
R.Design and Synthesis of a New Peptide Inhibitor of Topoisomerase IV In: XLI
Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq,
2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e
Biologia Molecular - SBBq. 2012.
GARCIA, A., LARISSA, BARBOSA, L. C. B., DELFINO, D. B., GARRIDO, S. S.,
MARCHETTO, R. Synthetic Peptides from YacG Protein as New Antimicrobials
Agents In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia
Molecular - SBBq, 2011, Foz do Iguaçu. XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira
de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. , 2011.

DELFINO, D. B., BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., LARISSA, GARRIDO, S. S.,
MARCHETTO, R. Nanoemulsion as Promoter of Permeability for Peptide Inhibitor of
Bacterial Topoisomerases In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de
Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq,, 2011, Foz do Iguaçu. XL Reunião Anual
da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq,. , 2011.

ARTIGOS PUBLICADOS
BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., GARRIDO, S. S., DELFINO, D. B., SANTOS, L.
N., MARCHETTO, R. Design and Synthesis of Peptides from Bacterial ParE Toxin as
Inhibitors of Topoisomerases. European Journal of Medicinal Chemistry. v.54, p.591
- 596, 2012.

BARBOSA, L. C. B.; GARRIDO, S. S.; GARCIA, A.; DELFINO, D. B.; MARCHETTO,
R. Function inferences from a molecular structural model of bacterial ParE toxin.
Bioinformation , v. 4(10), p. 438-440, 2010.

BARBOSA, L. C. B.; GARRIDO, S. S.; GARCIA, A.; DELFINO, D. B.; GONCALVES,
R. D.; MARCHETTO, R. Easy Bioinformatics Analysis (EBiAn): a package for
manipulating and analyzing of short biological sequences. Bioinformation , v. 5(2), p.
43-45, 2010.

OUTROS
GARRIDO, S. S., GARCIA, A., MARCHETTO, R. Participação em banca de
MÁRCIO FALCI PENNISI. SÍNTESE E APLICAÇÕES DE INIBIDORES
PEPTÍDICOS DE TOPOISOMERASES ASSOCIADOS A SISTEMAS DE
LIBERAÇÃO CONTROLADA DE FÁRMACOS, 2012 (Farmácia e Bioquímica)
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Avaliador da primeira fase do XXV Congresso de Iniciação Científica da UNESP
2013.

IDIOMAS
1. Inglês: Básico
A minha esposa Ariane
Aos meus filhos Augusto e Arthur (que ainda está por vir)
A minha mãe, padrasto e irmão
A minha avó (em memória)
A todos que me deram forças nesta longa caminhada
AGRADECIMENTOS

Ao meu orientador, Prof. Dr. Reinaldo Marchetto por ter aceito mais este desafio,
pela sua contribuição e convivência ao longo deste período;

À minha colaboradora, Dra. Danuza Rossi, ao qual teve um papel de extrema
importância no desenvolvimento deste trabalho

Ao Prof. Dr. Eduardo Maffud Cilli, por sua contribuição nas condutas de laboratório,
instruções na operação de equipamentos, por não medir esforços em ajudar sempre
que possível e pela boa convivência;

Ao Prof. Dr. Saulo Santesso Garrido, pela sua contribuição através de discussões e
compartilhar idéias, sempre com o intuito de sempre melhorar o trabalho e pela
amizade adquirida;

Aos colegas de grupo, Camila, Ana Caires, Rute, Edson (Araketu), Aderson e Edson
(Crusca), pela boa convivência e amizade;

Aos demais colegas de laboratório, Mateus, Norival, Nata, Júlia, Esteban, Isabelle,
Aline e Paulo, pela boa convivência;

A todos os funcionários da seção de pós-graduação e técnicos do Departamento de
Bioquímica e Tecnologia Química;