Table Of ContentIngrid Alsos Lian
Mechanisms involved in the
pathogenesis of pre-eclampsia
and fetal growth restriction
Transcriptional analyses of placental and decidual tissue
Thesis for the degree of Philosophiae Doctor
Trondheim, January 2012
Norwegian University of Science and Technology
Faculty of Medicine
Department of Cancer Research and Molecular Medicine
NTNU
Norwegian University of Science and Technology
Thesis for the degree of Philosophiae Doctor
Faculty of Medicine
Department of Cancer Research and Molecular Medicine
© Ingrid Alsos Lian
ISBN 978-82-471-3303-3 (printed ver.)
ISBN 978-82-471-3304-0 (electronic ver.)
ISSN 1503-8181
Doctoral theses at NTNU, 2012:21
Printed by NTNU-trykk
MMekanismer relatert til utvikling av svangerskapsforgiftning og føtal
veksthemming
Genekspresjonsanalyser av placenta og decidua vev
Svangerskapsforgiftning (preeklampsi) og føtal veksthemming er alvorlige svangerskaps-
komplikasjoner og viktige årsaker til økt sykelighet og død hos gravide kvinner og deres avkom.
Selv om forståelsen av hvordan disse tilstandene oppstår har økt de siste årene, er det fortsatt
manglende kunnskap rundt mekanismene som bidrar. En rekke observasjoner tyder på at en
mangelfull utvikling av morkaken (placenta) kan ligge til grunn. I et normalt svangerskap vil
trofoblaster (morkakeceller) invadere og omdanne morkakens tilførende blodkar for å sørge for
stabil blodtilførsel til morkaken og fosteret under graviditeten. Ved preeklampsi og føtal
veksthemming er denne prosessen ufullstendig, noe som kan resultere i utilstrekkelig tilførsel av
blod og næringsstoffer til fosteret, morkaken og det underliggende vevet (decidua). Videre vil en
”syk” morkake respondere på redusert blodtilførsel ved å skille ut faktorer til kvinnens
sirkulasjon som kan forårsake skade på karendotelet, og føre til høyt blodtrykk og protein i
urinen (tegn på preeklampsi) hos affiserte kvinner.
Hensikten med arbeidet som presenteres i denne avhandlingen har vært å kartlegge hvilke
molekylære mekanismer som er assosiert med mangelfull morkakedannelse ved preeklampsi og
føtal veksthemming. For å gjøre dette, har vi blant annet tatt i bruk genekspresjonsanalyser, hvor
det er mulig å måle uttrykket av titalls tusen gener i én analyse.
Resultatene fra disse analysene viste at kvinner med preeklampsi i kombinasjon med føtal
veksthemming har økt genuttrykk av faktorer som påvirker kardannelse negativt i morkaken
sammenlignet med kvinner med isolert preeklampsi eller føtal veksthemming (studie I). Når
disse faktorene skilles ut til mors sirkulasjon kan de bidra til utvikling av preeklampsi. Nivået av
disse faktorene i morkakevevet ser ut til å ha sammenheng med alvorlighetsgrad av sykdom.
Videre fant vi nedsatt gen- og protein uttrykk av matrix metalloproteinase 1 (MMP1) i decidua
fra kvinner med preeklampsi og/eller føtal veksthemming (studie II). MMP1 er et viktig enzym
for nedbrytning av bindevevet i decidua, og lave nivåer av MMP1 kan være en mulig mekanisme
bak nedsatt trofoblastinvasjon ved disse tilstandene. I arbeidet som inngår i denne avhandlingen
ble også utrykket av alle gener i decidua fra kvinner med preeklampsi og/eller føtal
veksthemming sammenlignet med friske gravide. Denne sammenligningen viste at kvinner med
preeklampsi og føtal veksthemming hadde forstyrrelser i flere biologiske prosesser som tidligere
har vært assosiert med nedsatt oksygentilførsel til vev, som for eksempel endoplasmatisk
retikulum (ER) stress, forsvar mot oksidativt stress og fettsyremetabolisme (studie III). I videre
analyser fant vi at av ER stress responsen var aktivert ved føtal veksthemming, isolert eller i
kombinasjon med preeklampsi. Ved isolert preeklampsi så ER stress ut til å være mindre
fremtredende (studie IV). Dette kan være med på å forklare noen av de kliniske forskjellene som
sees ved preeklampsi og føtal veksthemming. Samlet sett har arbeidet i denne avhandlingen
bidratt til å kartlegge sentrale mekanismer knyttet til utvikling av preeklampsi og føtal
veksthemming, samt skapt noen nye hypoteser som bør undersøkes videre.
Kandidat: Ingrid Alsos Lian
Institutt: Institutt for kreftforskning og molekylær medisin
Veiledere: Professor Rigmor Austgulen og førsteamanuensis Mette Langaas
Finansieringskilde: Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet
Ovennevnte avhandling er funnet verdig til å forsvares offentlig for graden PhD i molekylærmedisin.
Disputas finner sted i Auditoriet, Medisinsk teknisk forskningssenter, fredag 27. januar 2012, kl. 12.15.
CCONTENTS
ACKNOWLEDGMENTS ........................................................................................................................i
ABBREVIATIONS ................................................................................................................................ ii
LIST OF PAPERS ................................................................................................................................. iv
1. INTRODUCTION .............................................................................................................................. 1
1.1 Definitions, diagnosis and management ...................................................................................... 1
1.2 Risk factors and long term complications .................................................................................... 3
1.3 Pathogenesis of PE and FGR ........................................................................................................ 4
1.4 Transcriptional analyses of PE and FGR .................................................................................... 14
2. AIMS OF THE STUDIES ................................................................................................................. 16
3. MATERIAL ..................................................................................................................................... 18
3.1 Study population ....................................................................................................................... 18
3.2 Tissue sampling and preparation ............................................................................................... 20
3.3 Ethical considerations................................................................................................................ 21
4. METHODS ...................................................................................................................................... 22
4.1 Microarray gene expression analyses ......................................................................................... 22
4.2 Quantitative RT-PCR analyses .................................................................................................. 23
4.3 Immunohistochemical analyses ................................................................................................. 24
4.4 Western blot analyses ................................................................................................................ 25
4.5 Statistical analyses ..................................................................................................................... 25
4.5.1 Microarray data analyses ................................................................................................... 25
4.5.2 Bioinformatic pathway analyses ........................................................................................ 26
4.5.3 Quantitative RT-PCR data analysis .................................................................................... 27
5. MAIN FINDINGS ............................................................................................................................ 28
6. DISCUSSION ................................................................................................................................... 30
6.1 Methodological considerations .................................................................................................. 30
6.1.1 Diagnostic criteria and phenotype ..................................................................................... 30
6.1.2 Tissue sampling .................................................................................................................. 31
6.1.3 Gestational age ................................................................................................................... 32
6.1.4 Some problems related to transcriptional analyses ............................................................ 33
6.1.5 Global versus targeted analyses of gene expression ............................................................ 35
6.2 Biological considerations – discussion of main findings............................................................. 36
6.2.1 Transcriptional analysis of placental tissue ........................................................................ 36
6.2.2 Anti-angiogenic factors in placental tissue ........................................................................ 36
6.2.3 Trophoblast differentiation and invasion ........................................................................... 37
6.2.4 Altered biological pathways in the pathogenesis of PE ...................................................... 38
6.2.5 ER stress in PE and FGR .................................................................................................... 41
7. CONCLUSIONS AND FUTURE PERSPECTIVES ........................................................................... 43
8. REFERENCES .................................................................................................................................. 45
PAPERS I-IV ...........................................................................................................................................
AACKNOWLEDGMENTS
The work presented in this thesis has been carried out at the Department of Cancer
Research and Molecular Medicine, the Norwegian University of Science and Technology
(NTNU) from 2004 to 2011, and at the Perinatology Research Branch, National Institute of
Child Health and Human Development, Detroit, USA, in spring 2006. The financial support
for the work was ensured trough the Medical Student Research Programme at the Faculty of
Medicine, NTNU, from 2004-2009 and trough a PhD grant from the Faculty of Medicine for
2009-2011.
First of all, I would like to express my gratitude to Professor Rigmor Austgulen for
undertaking the role as my principal supervisor, providing guidance and support throughout
the project. I highly appreciate the help from my co-supervisor Mette Langaas, who has
been an excellent and patient teacher of statistics and bioinformatics.
I also wish to thank my colleagues and friends at the Medical Student Research Programme,
with whom I have shared the frustrations of having ‘too much to do and too little time’ and
the experience of starting research early in medical school. I especially wish to thank
Johanne Toft for her enjoyable companionship during our four years together as research
partners in the Medical Student Research Programme.
I would like to thank previous and current members of the The Research Group of Human
Reproduction; Mona Fenstad, Linda Roten, Mari Løset, Siv Mundal, Line Tangerås, Guro
Stødle, Astrid Gundersen, Irina Eide, Åsa Johansson, Guro Olsen, Toai Nguyen, Ann-
Charlotte Iversen, Ann-Helen Leknes, and Kristin Rian in the Laboratory Group, for their
help, friendship, encouragement and inspiration. There have been many valuable
discussions over a cup of coffee.
I am grateful to my international collaborators Adi Tarca, Roberto Romero, Offer Erez,
Jimmy Espinoza, Daniel Lott, Matthew Johnson and Eric Moses for their contributions. The
experienced help from Toril Rolfseng, Borgny Ytterhus and Unn Granli at the Department
of Laboratory Medicine, Children’s and Women’s Health, NTNU, in immunohistochemical
analyses is deeply appreciated. I am also in debt to employees at the Norwegian Microarray
consortium, NTNU, for technical assistance in our second microarray experiment. I also
wish to thank Kristine Pettersen, Anne Gøril Lundemo and Caroline Pettersen for teaching
me how to do Western blot.
I highly appreciate all the mothers that participated in our study, and the doctors that were
involved in tissue collection, especially Irina Eide and Line Bjørge.
Finally, I thank my parents Vigdis and Jon-Inge and my sister Ingeborg, for their everlasting
love and support.
Ingrid Alsos Lian,
Trondheim, October 2011
i
AABBREVIATIONS
ANGPTL2 angiopoietin-like 2
ANOVA analysis of variance
ARL5B ADP-ribosylation factor-like 5B
ATF6 activating transcription factor 6
BMI body mass index
CAM cell adhesion molecule
cDNA complementary deoxyribonucleic acid
CS caesarian section
Ct cycle threshold
CVD cardiovascular disease
DNA deoxyribonucleic acid
ECM extracellular matrix
EIF2α eukaryotic translation initiation factor 2α
EMT epithelial to mesenchymal transition
ENG endoglin
ER endoplasmic reticulum
ERAP2 endoplasmic reticulum aminopeptidase 2
EVT extravillous trophoblast
FDR false discovery rate
FGR fetal growth restriction
FLT1 fms-related tyrosin kinase 1
FZD4 frizzled family receptor 4
GEE generalized estimating equations
GST glutathione s-transferase
HMOX1 heme oxygenase 1
I/R ischaemia-reperfusion
IDO indoleamine 2,3-dioxygenase
IPA ingenuity pathway analysis
IRE1 inositol-requiring enzyme 1
KDR kinase insert domain receptor
KYNU kynureninase
MAN1A2 mannosidase α, class 1A, member 2
MCAM melanoma cell adhesion molecule
MMP matrix metalloproteinase
mRNA messenger ribonucleic acid
NRF2 nuclear respiratory factor 2
PE pre-eclampsia
pEIF2α phosphorylated eukaryotic translation initiation factor 2α
PERK PKR-like ER kinase
ii
PLA2G7 phospholipase A2, group VII
PlGF placental growth factor
qRT-PCR quantitative real-time polymerase chain reaction
RMA robust multichip average
RNA ribonucleic acid
ROAST rotation gene set tests
ROMER rotation gene set enrichment analysis
ROS reactive oxygen species
sENG soluble endoglin
SEPS1 selenoprotein S
sFLT1 soluble fms-related tyrosin kinase 1
SGA small for gestational age
SLITRK4 SLIT and NTRK-like family, member 4
SOLAR sequential oligogenic linkage analysis routines
TGF-β transforming growth factor β
UPR unfolded protein response
VEGF vascular endothelial growth factor
XBP1 x-box binding protein 1
XBP1(S) x-box binding protein 1 spliced
XBP1(U) x-box binding protein 1 unspliced
ZEB2 zinc finger E-box binding homeobox 2
iii
LLIST OF PAPERS
Paper I Toft JH*, Lian IA*, Tarca AL, Erez O, Espinoza J, Eide IP, Bjørge L, Sun
C, Draghici S, Romero R, Austgulen R. Whole-genome microarray and
targeted analysis of angiogenesis-regulating gene expression (ENG,
FLT1, VEGF, PlGF) in placentas from pre-eclamptic and small-for-
gestational-age pregnancies. Journal of Maternal-Fetal and Neonatal
Medicine 2008;21(4):267-73. *both authors contributed equally
Paper II Lian IA*, Toft JH*, Olsen GD, Langaas M, Bjørge L, Eide IP, Børdahl PE,
Austgulen R. Matrix metalloproteinase 1 in pre-eclampsia and/or fetal
growth restriction: reduced gene expression in decidual tissue and
protein expression in extravillous trophoblasts. Placenta
2010;31(7):615-20. *both authors contributed equally
Paper III Løset M, Mundal SB, Johnson MP, Fenstad MH, Freed KA, Lian IA,
Eide IP, Bjørge L, Blangero J, Moses EK, Austgulen R. A transcriptional
profile of the decidua in preeclampsia. American Journal of Obstetrics
and Gynecology 2011;204(1):84.e1-27.
Paper IV Lian IA, Løset M, Mundal SB, Fenstad MH, Johnson MP, Eide IP,
Bjørge L, Freed KA, Moses EK, Austgulen R. Increased endoplasmic
reticulum stress in decidual tissue from pregnancies complicated by
fetal growth restriction with and without pre-eclampsia. Placenta
2011;32(11):823-29.
iv
Description:Resultatene fra disse analysene viste at kvinner med preeklampsi i kombinasjon med trophoblasts' ability to infiltrate the decidual tissue strongly depends on their ability .. Briefly, the placenta was located by manual palpation.