Gewinnung und Analyse von Patientendaten aus der Datenbank eines ...

214 Pages·2015·5.26 MB·German

Aus dem Bereich Klinische Medizin
der Medizinischen Fakult(cid:228)t
der Universit(cid:228)t des Saarlandes, Homburg/Saar
Gewinnung und Analyse von
Patientendaten aus der Datenbank eines
Krankenhausinformationssystems
Dissertation zur Erlangung des Grades eines Doktors der
Theoretischen Medizin der Medizinischen Fakult(cid:228)t
der UNIVERSIT˜T DES SAARLANDES
2015
vorgelegt von: Andreas Bock
geb. am: 23.09.1977 in Saarbr(cid:252)cken

Zusammenfassung. Es werden elektronische Daten erzeugt, sobald ein Mensch ein
Krankenhaus oder eine Arztpraxis als Patient besucht. Neben organisatorischen Daten
werden auch medizinisch relevante Patientendaten erhoben und entsprechend in einem
Krankenhausinformationssystem gespeichert. Die medizinischen Daten eines Patienten
werden in erster Linie f(cid:252)r dessen Behandlung relevant sein, aber es besteht darin noch
weiteres Potential. Die Betrachtung und der Vergleich mehrerer Patientendaten k(cid:246)nnen
zu einem zus(cid:228)tzlichen Erkenntnisgewinn f(cid:252)hren. Theoretisch sind in diesem Moment be-
reits f(cid:252)r Studienzwecke nutzbare medizinische Daten vorhanden. Es stellt sich die Frage,
ob der Zugri(cid:27) auf existierende Daten, jenseits der vorgegebenen Funktionalit(cid:228)ten, ei-
nes Krankenhausinformationssystems m(cid:246)glich ist und wie man diesen konkret umsetzen
kann.
Diese Arbeit behandelt die Gewinnung und Analyse von alphanumerischen Patien-
tendaten eines Krankenhausinformationssystems des Universit(cid:228)tsklinikums in Homburg.
Dabei werden theoretische und praktische Belange im Rahmen der Softwareentwicklung
innerhalb des Systems behandelt. Es wird gezeigt, dass die Gewinnung von lokalen Pa-
tientendaten mit verf(cid:252)gbaren Mitteln - also ohne weitreichende Nutzung zus(cid:228)tzlicher
Software - m(cid:246)glich ist. Zu einem Szenario geforderter Daten wird eine Strategie (e.g.,
Auswahlkriterium) entwickelt, wie man auf die gew(cid:252)nschte Patientenmenge und die be-
n(cid:246)tigten Daten (e.g., Diagnosen) zugreifen kann.
Zus(cid:228)tzlich zur Bildschirmausgabe im Krankenhausinformationssystem wird f(cid:252)r den
Export eine CSV-Datei verwendet. Diese dient als Schnittstelle f(cid:252)r externe Systeme. Es
wird zudem gezeigt, dass man diese Datei zur Vorbereitung externer Analysen weiterver-
arbeiten kann.

Collecting and Analyzing Patient Data
from the Database of a Hospital Information System
Abstract. Every time someone visits a hospital or a doctor’s o(cid:30)ce, electronic data
is generated. In addition to organizational data, medically relevant data is collected
and saved in a hospital information system. The patient’s medical data are (cid:28)rst and
foremost relevant for their treatment, but it has additional potential. Comparing the
data of multiple patients can generate additional insight. In theory, data usable in
research setting is already present at this stage. Accessing this existing data may be
possible in hospital information systems; the problem consists of the actual practice of
organizing such access.
This thesis discusses the possibility of collecting and analyzing patient data from the
hospital information system of the Homburg Teaching Hospital, emphasizing both theo-
reticalandpracticalconcerns. Thethesisconcludesthatsuchcollectionispossiblewithin
the existing system, without major additional software, is possible. I develop a strategy
(e. g., rules of selection) for a set of data which makes it possible to access the required
number of patients and the necessary data (e. g., diagnoses).
In addition to displaying these data in the hospital information system, the export
routine utilizes a CSV (cid:28)le to export them, making it possible to connect to external
systems. I will also show that (cid:28)les generated in this manner can be used to prepare
external analyses.

Inhaltsverzeichnis
Abk(cid:252)rzungsverzeichnis 11
I. Einleitung 13
1. Motivation 15
1.1. Aufbau dieser Arbeit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
1.2. Elektronische Patientendaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
1.2.1. Datenmodelle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
1.2.2. Einordnung der Daten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
1.2.2.1. Harte Patientendaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
1.2.2.2. Weiche Patientendaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
2. Studien 23
2.1. Organisation der Patientendaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
2.2. Verarbeitungswege . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
2.2.1. Papierbasierte Patientendaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
2.2.2. Elektronische Patientendaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
2.2.3. Vergleich der Vorgehensweisen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
3. Krankenhausinformationssysteme 27
3.1. Beschreibung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
3.2. Datenbanksysteme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
3.3. Datenbankmanipulationssprache . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
3.4. Handhabungsfehler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
3.5. Universit(cid:228)tsklinikum in Homburg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
3.5.1. Programmiersprache . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
3.5.2. Subsysteme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
7
Inhaltsverzeichnis
3.6. Klinik f(cid:252)r Neurologie im Krankenhaus P(cid:252)ttlingen . . . . . . . . . . . . . . 33
3.6.1. Motivation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
3.6.2. Beschreibung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
3.6.2.1. Beginn und Einf(cid:252)hrung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
3.6.2.2. Dokumentation mit Textbausteinen . . . . . . . . . . . . 34
3.6.2.3. Weitere Eigenschaften . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
3.6.2.4. Studien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
II. Methoden zur Gewinnung und Analyse von Patientendaten 37
4. Ausgangslage am Universit(cid:228)tsklinikum Homburg 39
4.1. Mikrobiologieszenario in eureca . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
4.2. Grundlage zur Datengewinnung aus dem SAP-System . . . . . . . . . . . 44
4.2.1. Theoretische Vorarbeit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
4.2.2. Praktische Umsetzung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
5. Erweiterte Datengewinnung f(cid:252)r das Mikrobiologieszenario 55
5.1. Informationen zur Diagnose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
5.1.1. Hauptdiagnose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
5.1.2. Aufnahme- und Entlassungsdiagnose . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
5.1.3. Text zu International Classi(cid:28)cation of Diseases . . . . . . . . . . . 61
5.2. Stammdaten zum Patienten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
5.3. Patientenbewegungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
5.4. Informationen zur Medikation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
5.5. Andere Daten bzw. Informationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
5.6. Ergebnisausgabe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
5.6.1. Verarbeitung der internen Tabelle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
5.6.2. Darstellung im SAP List Viewer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
5.6.3. Ausgabe als Datei auf dem Pr(cid:228)sentationsserver . . . . . . . . . . . 74
5.6.4. Ausgabe als Datei auf dem Applikationsserver . . . . . . . . . . . . 74
5.6.5. Beschreibung der Ausgabe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
5.6.6. Vorteile der jeweiligen Ausgabe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
5.7. Externe Datens(cid:228)tze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
5.8. Datentransport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
8
Inhaltsverzeichnis
5.8.1. Bereitstellung auf dem Applikationsserver . . . . . . . . . . . . . . 84
5.8.2. Bereitstellung auf dem Hybaseserver . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
5.8.3. Abruf der Daten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
5.9. Manuelle Abfrage in SAP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
6. Datenschutz 87
6.1. Personenbezogene Daten im Mikrobiologieszenario . . . . . . . . . . . . . 87
6.2. Ma(cid:255)nahmen w(cid:228)hrend der Erhebung und Verarbeitung . . . . . . . . . . . 88
6.3. Praktische Umsetzung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
6.3.1. Patientendaten aus SAP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
6.3.2. Patientendaten aus der Mikrobiologie. . . . . . . . . . . . . . . . . 91
7. Weiterverarbeitung der gewonnenen Daten 95
7.1. Inhaltliche Vorarbeit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
7.2. Praktische Umsetzung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
7.2.1. Zugri(cid:27) auf einzelne Werte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
7.2.2. Zugri(cid:27) auf die Medikation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
8. Analyse der gewonnenen Daten 105
8.1. Innerhalb von SAP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
8.1.1. Tabellenausgabe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
8.1.2. Pr(cid:228)sentationsgra(cid:28)k . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
8.2. Daten auf dem Pr(cid:228)sentationsserver . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
8.3. Daten auf dem Applikationsserver. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
9. (cid:220)bertragbarkeit 113
III. Ergebnisse 115
IV. Diskussion 123
Literaturverzeichnis 129
Abbildungsverzeichnis 139
9
Inhaltsverzeichnis
Tabellenverzeichnis 143
Programm-Listings 145
V. Anhang 147
A. Programmcode aus Micro11 149
B. Programmcode aus Graphstation 177
C. Programmcode aus Labanom 183
D. Programmcode aus Saptransfer 191
E. Wertezuordnung zur Clinical Document Architecture 207
E.1. Krankenhausinformationssystem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 207
E.2. Antibiotika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211
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